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如何用imagej处理荧光漂白恢复实验数据

发布时间:2023-10-24 17:42来源:www.sf1369.com作者:宇宇

一、如何用imagej处理荧光漂白恢复实验数据

要用ImageJ处理荧光漂白恢复实验数据,需要梁梁进行以下步骤:

步骤1:打开ImageJ软件,导入荧光漂白恢复实验的数据图像。

步骤2:选择“菜单”-“分析”-“荧光恢复”,进入荧光恢复窗口。

步骤3:在荧光恢复窗口中,选择“ROI”(感兴趣区域)工具,用鼠标在图像上选择一个感兴趣的区域。

步骤4:在“荧光恢复”窗口中,设置曲线拟合参数,包括初始强度、最终强度、半衰期等。

步骤5:点击“荧光恢复”窗口中的“开始拟孝渣埋合”按钮,软件会自动进行曲线拟合,并输出荧光恢复曲线和拟合参数。

荧光漂白恢复实验是一种常用的荧光显微镜技术,用于研究细胞内蛋白质的动力学行为。在实验中,通过荧巧蚂光显微镜观察标记蛋白的荧光强度在光照或荧光漂白的作用下的变化,从而推断蛋白质的运动、交换和稳定性等参数。

ImageJ是一款开源的图像处理软件,可以用于荧光显微镜图像的分析和处理。在荧光漂白恢复实验中,ImageJ可以帮助我们计算荧光恢复曲线和拟合参数,进而分析蛋白质的动力学行为。

二、怎么用origin将荧光光度分析数据记录下来

一、数据准备

这些是从仪器上export的数据,我这里的数据都是已经经过扣除了空白水样丛厅宽、渗亮一二级瑞丽散射,并且我这里对自己扣除了空白之后的数据如果成了负值进行了归0处伏档理,行是ex,列是em(有的仪器导出的数据需要进行转置,比如我的),我这里的数据是88列250行,如下图:

二、绘图

打开Origin,新建矩阵

插入数据,把excel中的数据复制过去:

点击等高线颜色填充:

绘制完成:

有一说一Origin跟我仪器画出来的很像,因为仪器内部嵌入的就是Origin的处理软件,所以参数调节的方式也一模一样,双击横纵坐标轴可以改坐标轴的属性包括标签网格线等等:

双击右边边缘线,可以修改等高线图的颜色和间隔:

当然了Origin也可以绘制其他的图像,用我们现成的数据,比如说等高线剖面图,三维立体坐标(3D颜色映射曲面)的图,同样各种参数都是可以修改的,大家可以根据自己的需求进行修改:

但我这里数据什么的都处理的不太好可能画出来不太好看,大家一定要重视数据的预处理,对后面各种分析有很大的帮助。

一、数据准备 这些是从仪器上export的数据,我这里的数据都是已经经过扣除了空白水样、一二级瑞丽散射,并且我这里对自己扣除了空白唯贺之后的数据如果成了负值进行了归0处理,行是ex,列是em(有的仪器导出的数据需要进行转置,比如我的),我这里的数据是88列250行,如下图: 二、绘图 打开Origin,新建矩阵 插入数据,把excel中的数据复制过去: 点击等高线颜色填充: 绘制完成: 有一说一Origin跟我仪器画出来的很像,因为仪器内部嵌入的就是Origin的处理软件,所以参数调节的方式也一模一样,双击横纵坐标轴可以改坐标轴的属性包括标签网格线等等: 双击右边边缘线,可以修改等高线岁则图的颜色和间隔: 当然了Origin也可以绘制其他的图像,用我们现成的数据,比如说等高线剖面图,三维立体坐标(3D颜色映射曲面)的图,同样各种参数都是可以修改的,大家可以根据自己的需求进行修改: 但我这里数据什么的都处理的不太好可能画出来不太好看,大家一定要重视数据的预处理,对后面各种分析有很大的帮乎山棚助。

三、怎么用spss处理双荧光报告基因数据

录入完数据后,你可以先进行基础的数据统计--描述性统计。然后根据你的数据结果再看是否需要相关回归或者其他分析。spss里面的描述统计主要在analyze——descriptive里面,其中有描述统计、频数统计、交叉分析。

描孝搏备述性统计分析是统计分析的第一步,先选择analyze,你就能看到descriptive,然后鼠标再巧毁选Descriptive 菜单中,最常用的是列在最前面的四个过程:Frequencies过程的特色是产生频数表;Descriptives过程则进行一般性的统计描述;Explore过程用于对数据概况不清时的探索性分析;Crosstabs过程则完成计数资料和等级资料的统计描述和一般的统计检验。

先选择analyze,---再选descriptive

打开任意的分析窗口后,你把想分析的数据选入,可以一起按鼠标左键选中按中间按钮加入,然后选择单击后弹出Statistics对话框,用于定义需要计算的其他描述统计量。你可以分析均数(Mean)、中位数(Median)、众数(Mode)、总和(Sum)等等。 然后还可以点Charts对话框,选择直方图、饼图等来绘图。都确定好后,选择单击Continue钮 ,然后选择OK。就可以了。直接就会有输出结果银轮。

你可以先看看描述性统计的结果,有没有什么缺失值或者不符合实际的数据出现。要是有,你需要纠正数据,再用描述统计进行分析。

我觉得说的挺详细的了。呵呵~~~~

四、绝对荧光定量PCR的数据分析

现在最常没启用的两种分析实时定量PCR

实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数;相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2-△△CT方法是实时定量PCR

实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法,即相对定量的一种简便方伍培法。本文介绍了该方法的推导,假设及其应用。另外,在本文中我们还介绍了两种2-△△CT衍生方法的推导和应用,它们在实时定腔察唯量

PCR

数据分析中可能会被用到。

希望对您有所帮助